北檢的起訴書共達168頁，其中載明柯文哲涉及收賄或侵占多達8,000萬，所犯罪刑包括在京華城案中圖利財團百億不法利益並收受千萬賄賂，侵占數千萬政治獻金，犯後在辦公處所遭查獲撕碎便條紙，指示共犯出境及木可內帳有無檢查等文字，有違背職務之行為收受賄賂罪嫌，量處有期徒刑15年，併科罰金5,000萬元，褫奪公權10年。
在侵佔政治獻金部分，量處有期徒刑5年；以木可公司名義公益侵占政治獻金罪嫌，量處有期徒刑6年； 另犯對眾望基金會背信罪嫌，量處有期徒刑2年6月。
在北檢所發的新聞稿中，詳列柯文哲以「都市更新」為競選臺北市市長重要政見，且親自為京華城案等都市發展論壇致詞，深知都市更新法令，明知京華城公司申請最高 20％容積獎勵之都市計畫草案內容違背都市更新條例（下稱都更條例）、都市更新建築容積獎勵辦法（下稱都更容積獎勵辦法）等法令。
柯文哲涉京華城容積爭議、關鍵人物一次看懂
但柯文哲在市長連任期間，為籌謀培植政治實力及募集資金，因沈慶京不堪京華城購物中心營運損失，持續向柯文哲訴求協助回復京華城容積一事，109年2月20 日與沈慶京在市政府市長辦公室單獨會面時，各起交付、收受賄賂，及共同圖利之犯意聯絡，一路護航京華城公司，最終使鼎越公司取得本案土地最高20％容積獎勵之建造執照。
彭振聲、邵琇珮等人明知違背法令，仍罔顧都發局、都委會、都審會行政程序中，眾多基層公務員、都委會委員提出之違法質疑，與柯文哲、沈慶京共同圖予京華城公司、鼎越公司高達 121 億 545 萬元之不法利益。
起訴書中指出，柯文哲在過程中收受沈慶京共 1,710萬元賄款。柯文哲明知京華城公司不符北市府 107 年都市計畫刪除土地 120,284.39平方公尺樓地板面積，提起訴願遭內政部駁回，北市府認定並無違失，且107年都市計畫所認定事實基礎，沒有毫無理由及法令依據能作成與北市府107年都市計畫相異的認定，竟在京華城公司提起行政訴訟期間，在109年3月10日便當會裁示「都發局將京華城公司陳情案送都委會研議」，為京華城案開啟都委會研議程序。
沈慶京見柯文哲已踐履承諾，交代朱亞虎等人尋找威京集團7名人頭，從威京集團總部領取款項後，由該7名人頭各自匯款30萬元佯為捐贈民眾黨政治獻金，實為交付210萬元賄賂給柯文哲。
李文宗經朱亞虎通知賄款210萬元已交付，且附上捐款人頭名單，據此向柯文哲報告後，即傳送訊息給朱亞虎表達柯文哲感謝之意。
沈慶京見柯文哲一路護航鼎越公司取得最高 20％容積獎勵的建造執照，在111年9月12日傳送感謝訊息給柯文哲，並表達111年10月18舉行京華廣場動土典禮，柯文哲將是其唯一邀請的政治人物，沈慶京並交代秘書自其名下帳戶提領 1,600 萬元現金。
柯文哲在出席京華廣場動土典禮後，於111年10月19 日至同年11月1日間親自收受沈慶京交付現金1,500 萬元賄款，並以EXCEL檔案「工作簿」記載：「日期2022/11/1-姓名小沈-數字1500-公司-用途-經理人沈慶京」，儲存在其所有之行動硬碟中。
柯文哲侵占民眾黨政治獻金
在政治獻金公益侵占案中，柯文哲侵占民眾黨政治獻金600萬元。柯文哲身為民眾黨黨主席，竟將邱佩琳轉交「周ＯＯ文」、「謝國樑之母親林曼麗」、「林命群」捐贈予民眾黨之政治獻金各200萬元，均予侵占入己，而未存入民眾黨政治獻金專戶，合計600萬元。
另外北檢也查出，柯文哲、李文宗、李文娟共同侵占柯文哲政治獻金及民眾黨政治獻金共6,234萬6,790元。
根據北檢調查，柯文哲等以肖像權授權金、支付木可公司員工薪資、投資營利事業等方式，侵占政治獻金1,724萬1,036元。柯文哲為作他用而規避政治獻金法所明定支出用途限制，以商業手段作為包裝，先與木可公司簽訂肖像權同意書，約定將柯文哲的肖像權獨家授權給木可公司，再由木可公司與柯文哲競選辦公室簽訂「授權委託作業管理合約書」，約定由木可公司將柯文哲的「肖像行使權」授與競選總部。
李文宗則指示李文娟以肖像權授權金名義，由政治獻金共匯付1,500萬元予木可公司，將政治獻金挪供柯文哲私人使用。柯文哲另以支付木可公司員工薪水名義方式，由政治獻金匯款共124萬1,036元給木可公司。此外，柯文哲投資邱復生的營利事業，也是由政治獻金匯款100 萬元給國際電影公司。
除此外，柯文哲等人利用木可公司侵占政治獻金共4,510萬5,754元。柯文哲、李文宗、李文娟明知募款小物之目的係為謀求民眾支持柯文哲競選總統所捐贈政治獻金，募得款項應存入柯文哲政治獻金專戶，但卻是以木可公司網路商店「木可好店」進行募款，透過柯文哲臉書、IG、民眾黨官方網站等媒體宣傳第三波募款換小物，利用民眾為支持柯文哲而捐款政治獻金以換取募款7 小物，進而點選「木可好店」網頁，連結至木可公司網站捐贈政治獻金時，透過第三方支付平台綠界公司將所得款項匯入木可公司帳戶。合計以木可公司侵占募款小物募款所得之政治獻金共4,133萬5,588元。
北檢同時發現，KP SHOW募款演唱會也是為柯文哲從事政治、籌募競選資金之活動，所得應屬政治獻金，同樣由木可公司帳戶收受KP SHOW募款演唱會盈餘77萬166元。更以木可公司收受採風公司所捐與民眾黨政治獻金共300萬元，並由李文娟以木可公司開具不實統一發票4張，交付給採風公司。
第三大部分在於挪用眾望基金會款項支付競辦員工薪資背信案。柯文哲、李文宗明知眾望基金會章程第6條載明「本基金會以辦理臺北市社會福利（關懷）為目的」，竟違背上開眾望基金會章程規定，將民眾對眾望基金會之捐款挪供柯文哲聘請周榆修、戴于文等13 位員工，實際工作內容卻是處理柯文哲總統選舉相關活動及後續黨務活動，統計在111年12月至113年8月之期間，共支付827萬。
第四部分為政治獻金專戶申報不實案。北檢調查，端木正明知柯文哲政治獻金專戶申報內容未達平衡、收支諸多疑義，尚未完成查核，竟出具不實查核報告交付予監察院。且在監察院以申報帳目登載未完整，要求退回補正時，竟在未取得任何憑證下，擅自於支出8 項目登打「時樂公司」、「尼奧公司」、「木可公司」、「佳聖公司」共9筆不實交易，足生損害於監察院查核政治獻金正確性。
