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關於巧克力的迷思很多。
過去幾百年，商人聲稱可可亞是春藥、健康萬靈丹。瑪雅人甚至使用可可亞當作某種現金，把可可亞和獨裁者埋在一起。民族植物學家布雷特（Nat Bletter）說，「他們似乎相信可可亞能幫助人進入死後的世界並在冥界存活」。
幾千年來，圍繞著可可亞的迷思不斷增加，科學家也致力瞭解可可亞對人體健康有什麼影響。可可亞包括許多稱作黃烷醇的生物活性化合物，包含抗氧化劑和抗發炎特性。
最近幾年，研究證實可可亞中的黃烷醇，有助改善血液流動、降低血壓、降低血栓風險。至少要含有35%可可亞才能被稱作黑巧克力。含有超過70%可可亞的巧克力對健康最好，但專家建議小量食用。
巧克力有益健康的說法，有獲得政府背書嗎？
早在2018年，製造巧克力和可可亞產品的公司百樂嘉利寶（Barry Callebaut AG Switzerland）向美國食品暨藥物管理局（FDA）提出請願，希望准許標籤上強調有益健康，並指出食用富含黃烷醇的可可亞，與降低心血管疾病風險有關。
