不過，學界（醫學院院長）和業界（醫院院長）屬意的其他優秀醫學院，其實大不相同。
調査發現，除了台大醫學院外，受業界肯定的醫學院依序是高雄、台北、陽明與中國醫藥學院。學界則依序較認同長庚、陽明、高雄醫學院的表現（表一）。
學界與業界看法殊異，顯示業界並不認爲名校出身的學生，必然成為好醫生。奇美醫院院長梁安億就認為，醫師工作表現與畢業後的養成敎育較有關，與畢業學校關係較小。
業界與學界心目中的優秀醫生條件也略有不同（表二）。代表業界的醫院院長最在乎能不能醫好病人的「專業能力、知識」，代表學界的醫學院院長則較看重醫生是否關心病人。
但不少醫院院長也不忘指出，要成爲優秀醫生，除了種種「能力」，精神上的素養、醫學倫理也愈來愈重要。
馬偕醫院院長詹錕鋙便認爲，醫生也要有文學、藝術、運動等修練，他更不諱言應培育看輕「錢」的醫生。
從陽明醫學院改制而成的陽明大學校長張心湜也感歎，台灣醫學院學生雖然聰明，卻較自私、本位、不關心別人，缺乏行醫必要的「三心」──同情心、關懷心、同理心。
根據各醫學院院長的評選，目前仍以台大、陽明、長庚醫學院的課程設計與師資較佳，能培育具有優秀醫師條件的學生（表二）。
值得注意的是，軍醫體系的國防醫學院雖然與一般醫學院較少有交流，在課程、師資方面仍然頗受肯定。
調查結果也顯示，醫院院長較認同台大、高雄、陽明、長庚醫學院畢業生的專業能力、工作態度與學習能力（表三）。
但若論及誰最合群、合作，則以高雄醫學院最受好評。而在其他方面表現平平的台北醫學院、國防醫學院，調查結果顯示，也比台大醫學院畢業生更懂得如何與人合作。
（「最佳醫學院」調查根據敎育部大學名錄，共計十所醫學院校進行調查。醫院部份共發問卷三〇份，回收十八份，回收率六〇％。學校部份共發出問卷一〇份，回收八份，回收率爲八〇％。調查時間爲二月二日至二月二十日。）
（詳見PDF）
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