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此計畫最重要的關鍵即為資金，歐巴馬也將請求國會核可計畫首年所需的1億美元預算。美國國家衛生局每年的神經科學支出為55億美元，與之相比，這個數目並不大，但也遠高於人類基因組計畫首年的預算2800萬美元。
將BRAIN與人類基因組計畫比較，確實難以避免，但也有些誤導之虞。人類基因組計畫的目標十分明確，1990年之時，亦已經確知人類基因組的規模。此外，研究者知道要如何進行研究，只不過以當時科技來看，可能得花上數個世紀才能完成，但至少在一開始，研究者已經確定此作法可行。
BRAIN則相當不同。首先，沒有人知道此計畫的成果為何。如果研究者非常幸運，他們說不定可以解答重大謎團，或是了解神經細胞如何處理資訊，進而找出建造電腦的更好方法，或是揭露大腦學習事物的秘密，為教育點亮明燈等等。
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