根據eatingwell網站指出，咖啡因、多酚，以及咖啡的輕微利尿作用，都可能干擾某些維生素與礦物質的利用率。藥師Philip Ngo表示：「例如咖啡因會降低鐵質吸收，並可能透過利尿作用影響其他營養素。」
1、鐵質
鐵對於生長、荷爾蒙生成與細胞功能都至關重要，但也是常見缺乏的營養素，因此許多人會被醫師建議補充。
藥師Bo Wang指出：「與咖啡一同攝取鐵劑或強化鐵質的穀片，會讓身體吸收較少的鐵。長期大量喝咖啡，甚至可能影響骨骼與礦物質健康。」有研究發現，咖啡與鐵同時攝取會使吸收率下降54%，若再搭配早餐，吸收率更低。
造成影響的不是咖啡因，而是咖啡與茶中的綠原酸（chlorogenic acid），這種多酚會強烈抑制非血基質鐵（植物性食物與保健品中的鐵）的吸收。研究者認為，多酚會影響腸道吸收鐵的方式。
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建議：將鐵劑與咖啡間隔至少1小時，並搭配富含維生素C的食物（如檸檬、橙子）一起吃，有助提升吸收率。
2、維生素D
維生素D很難僅靠飲食攝取足夠，因為天然食物中含量不多，不過人體可以透過曬太陽自行合成。
藥師Elise Kim表示：「研究顯示咖啡因可能會降低維生素D受體的表現，進而降低體內維生素D水準，但臨床影響仍在研究中。」一項2021年的研究發現，咖啡因攝取較高的人，血液中的維生素D水平較低。
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建議：維生素D與咖啡間隔至少1小時；此外，因維生素D為脂溶性營養素，建議搭配含健康油脂的餐點一同服用，吸收效果更佳。
3、維生素B群
維生素B群（水溶性維生素，包括B1、B2、B7、B9、B12等）對能量代謝、神經功能與紅血球生成都很重要。但水溶性維生素在體內不易儲存，需定期補充。
Kim說明：「咖啡因的利尿作用會增加維生素B的流失，尤其是高咖啡因攝取時。」研究顯示，喝咖啡的人體內維生素B水準通常較低，主要原因可能是隨尿液流失。
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建議：避免與咖啡或茶同時攝取，最好間隔一小時。維生素B與C在有無進食的情況下都可以補充，但通常餐後服用較易吸收。
4、鎂
鎂參與蛋白質合成、血糖控制、血壓調節及睡眠品質等多項重要功能。雖然豆類、堅果與優格中含有鎂，但許多人仍攝取不足。
Kim 指出：「咖啡因會增加鈣與鎂的尿液流失。」
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建議：若你習慣在晚上補充鎂以幫助睡眠，避免睡前喝咖啡。因為咖啡因不僅干擾睡眠，還可能降低鎂促進深層睡眠的效果。
5、鈣
與鎂相似，鈣也會受到咖啡利尿作用的影響。Kim表示：「咖啡因可能會降低鈣的吸收，但其臨床影響仍不完全明確。」有研究顯示，攝取咖啡因的人，腎臟排出的鈣比安慰劑組多出77%。
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建議：若喝咖啡時加入牛奶，可部分抵消鈣流失。鈣補充劑最好與咖啡間隔至少1小時，或在喝咖啡前2小時服用，以提升吸收效果。
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