總統府在兩週前就已經掌握訊息和警訊，吳釗燮說明，同時一直努力到最後一刻。今天清晨四點即已接獲訊息確認巴拿馬將和中國建交，在七點由他親自召開國安會議，八點總統蔡英文也已和國內高層首長開會研商因應。
以下為總統府所發出五點聲明全文：
一、對於巴拿馬共和國背棄多年邦誼，決定終止與我國外交關係，並宣佈與中華人民共和國建交，我們表達高度遺憾與不滿。
過去多年，我國政府與人民在各領域上，全力協助友邦分享發展經驗與成果，我們有能力並且樂意在各方面協助友邦，但我們不會以金錢的投入來進行外交上的競逐。
二、對於北京當局過去這段期間，持續透過各種手段，操作所謂「一中原則」，打壓台灣國際空間，這樣的做法不僅是對台灣人民生存權利的公然威脅，更是對台海以及區域間和平穩定的公然挑釁。對此，我們表達嚴厲的譴責。
三、作為國際社會一員，我國政府善盡國際責任，全力維持台海和平與區域穩定的立場堅定並且一致，而北京當局的做法，是衝擊現狀，是將兩岸由和平推向對抗的錯誤做法。因此，政府將重新評估兩岸情勢。
我們也要正告北京當局，做一個有責任感的區域大國，應立即停止任何繼續傷害區域穩定，傷害台灣人民的行動，將兩岸關係帶回正確的軌道。
四、一個清楚的事實是，不論任何政黨執政，兩岸政策立場如何，都共同面對相同的外部挑戰，都面對來自北京方面的持續打壓，這是全體國人不分朝野必須正視的事實。兩岸的課題不在於政黨間的政策差異，也不在於如何向對岸表態，而在於全體國人是否能夠團結因應，一致對外。
五、守護國家自由民主，確保國人安全與福祉是政府無可拋卻的責任，對於各項困難與挑戰，政府會持續謹慎因應，盡一切努力維護國家利益，請國人放心。
