總存款只佔台灣全體金融機構六．三％，總放款只佔全體放款四．七％的農漁業基層金融，儘管比重不高，但卻一直是金融專業界認為相當頭大的問題。（見表）
由於基層金融歸屬農漁會總幹事管理，而總幹事是農漁民民選，並非專業人士，當這幾年大環境逐漸不景氣時，基層金融可說首當其衝，呆帳率逐漸惡化，遠遠高於其他金融體系，從一九九五年的四％，達到今年九月的一六．四％。（見表）
一家國營行庫董事長私下表示，基層金融讓台灣的金融業在國際上抬不起頭，每次國際評比的時候，基層金融都把台灣的分數往下拉。行政院長游錫?也曾表示，基層金融不改善，每拖三天，國庫就要支出一億元的代價。
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