檢調大動作介入聯電偵查，由於事涉高科技產業及敏感的兩岸經貿政策，不但引起業者極大震撼，亦再度引發台灣高科技產業西進政策以及租稅優惠政策之檢討。
由於開放高科技產業西進的時程及內容，以及產業租稅減免的範圍，多不涉及修法，前者主管機關可不定期召開會議，進行可開放項目之調整；而後者，主管機關則可依據《促產條例》修訂可納入獎勵的產業，亦即政府部門具單獨主導權，然對此二廣受社會爭議的政策，政府以往的作為卻頗值得商榷。
以高科技產業西進政策為例，由於兩岸特殊關係，因此，赴大陸投資的業者，除需關注一般商業行為的營運風險外，尚需承受兩岸特殊的政治風險。
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