三二二大選過後，北京當局反應低調，除了是對陳水扁的高度不信任，擔心他在卸任前還會製造事端之外；更重要的是，國民黨重新執政之後，因台獨危機引發的兩岸主權衝突已經緩和了，兩岸的政治體制差異卻更加顯著化。一個民主台灣對中國的長遠影響，特別是對迄今仍躊躇不前的中國政治改革可能產生的衝擊，中共高層顯然還沒有作好足夠的評估與準備。這是北京當局保持緘默的另一個原因。
然而馬英九卻沒有準備期，他必須立刻上手。未來幾個月，有許多棘手問題等著他去克服，包括：
四月：正式就職前，馬英九要挑選一位足孚眾望的行政院長，提出一批能夠讓人一新耳目的內閣名單。國民黨失去政權八年，許多人患了強烈的權力饑渴症，馬英九此時更要有說不的勇氣。
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