中研院院長翁啟惠，基於什麼事證列被告？

為什麼翁啟惠回國短短6天，從府院說明、檢調約談蒐索到列為被告？ 還是背信罪加貪污治罪條例的被告？
 
士林地檢署解釋基於兩個原因，一、中央研究院院長翁啟惠在中研院處理事務期間，有無意圖為自已不法的利益，違背其任務的行為，損害中研院的利益，因此以背信案立案偵查。
 
二，檢方21清晨複訊翁啟惠等三人時，斟酌法務部調查局初訊內容、全卷資料，綜合考量後，認為有釐清三人有無對於其職務上的行為而為交付、收受浩鼎公司股票不法財物的事情，因此，將翁啟惠等三人增列為貪污治罪條例被告。
 
士林地檢署並分別對翁啟惠限制出境、張穗芬以交保新臺幣50萬元並限制出境，張念慈交保新臺幣100萬元並限制出境。
 
為什麼變成背信罪加貪污治罪條例的被告？
 
先來看什麼是背信罪？根據我國刑法第342條，依照法院實務說明是：「為他人處理事務，違背誠信義務所要求的信任關係，從事違反任務的行為，而意圖為自己或第三人不法之利益或損害本人之利益。」
 
眾達國際法律事務所余明賢師表示，據此項法條來看，檢調懷疑翁啟惠列為被告的原因為，檢調懷疑翁啟惠賤賣技術涉背信罪嫌，背信的對象是中研院。因為檢調發現中研院兩度技轉給浩鼎，翁啟惠扮演決策關鍵角色。
 
中研院技轉給浩鼎生技的研究專利2010年專利授權「大規模酵素合成寡醣」技術與第二代乳癌疫苗OBI-833。