就在最低稅負制實行前夕，台積電創始大股東台灣飛利浦建元公司，將手中持有的鉅額股票，全數轉予荷蘭母公司。創下一千兩百億台幣單筆歷史成交量的同時，也引發賦稅公平與投資誘因孰輕孰重的爭議。
根據台灣飛利浦公關資深經理洪悅容指出，台灣飛利浦建元將台積電股票全數轉給荷蘭母公司，主要是因為企業集團發展的策略，分成半導體、行動通訊、數位家庭、汽車與識別部門等四個核心事業。而台積電屬於半導體事業部的投資，此次股權移轉是由母公司籌劃。
致遠會計師事務所會計師呂旭明指出，最低稅負制是使原本就有移轉股權計劃提前實現的觸媒。二○○六年一月一日最低稅負制實施之後，營利事業的證券交易所得都要加回基本所得額課徵一○％的營利事業所得稅。如果在二○○五年十二月三十一日前的交易所得，則可以依現有稅法規定，享有免徵所得稅的優惠。
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